Pierre Hamon pratique l'ensemble du répertoire «classique» de la flûte à bec : du baroque au contemporain, en remontant jusqu'au Moyen Age et à la Renaissance. Il joue également des cornemuses.

Il a aussi étudié les flûtes doubles du Rajhastan et commencé, en 1997, l'étude de la musique indienne et de la flûte Bansuri auprès du maître Hariprasad Chaurasia. Il multiplie les rencontres musicales, avec d'autres artistes, ou au travers des répertoires abordés, y compris avec les musiques traditionnelles. Il se produit régulièrement en solo et crée cette saison un duo avec le percussionniste italien Carlo Rizzo.

Soliste régulièrement invité par les Arts Florissants ou A sei voci, pour le versant baroque, il a également circulé dans de nombreux groupes, parmi lesquels Hesperion XX ou Gilles Binchois pour le répertoire médiéval.

Il est membre cofondateur des ensembles Alla francesca (avec Brigitte Lesne et Emmanuel Bonnardot) et La Canzona (avec Elisabeth Joyé et Hager Hanana).

Pierre Hamon est titulaire du CA de flûte à bec, Il est régulièrement invité lors de master classes en France et dans le monde et enseigne au CNSM de Lyon et au Conservatoire Erik Satie, à Paris. Il est aussi codirecteur artistique du Centre de Musique Médiévale de Paris.