Edouard Oganessian a étudié le piano avec Mikhaïl Voskressensky et l’orgue avec Léonide Roysman au Conservatoire Tchaïkovski de Moscou. Les deux instruments s'avèrent très vite indissociables dans sa vie de musicien, relevant, en dépit de techniques et d'expressions totalement différentes, d'un seul et même objectif artistique.

Edouard Oganessian donne de nombreux récitals en France, en Russie et dans toute l’Europe, en particulier en Allemagne et dans les Pays baltes. Son interprétation de la musique de Jean-Sébastien Bach, de Liszt et de Mendelssohn est saluée par la presse allemande. Il consacre une grande partie de son travail à l’enregistrement et aime, au-delà de son vaste répertoire classique, interpréter des œuvres rares. En 1998 paraissent les quatre Sonates pour violoncelle et piano de Max Reger avec Alexandre Kniazev (label 3D Classics) que la presse musicale française considère comme un enregistrement de référence. Il crée l'Opus 127 de Max Reger à l’orgue de Notre-Dame de Paris en 2002 et trois œuvres du compositeur russe contemporain Oleg Iantchenko (Méditation, Rêve de Noël et La Cathédrale de Spire) à l’église Saint-Eustache. En 2003, il joue à Saint-Louis-des-Invalides la transcription pour orgue de Max Reger de la Deuxième Légende pour piano de Franz Liszt Saint François de Paul marchant sur les flots et cette même année, enregistre Schwanengesang de Schubert dans la double transcription de Liszt - Drillon pour alto et piano (label Universal).

Edouard Oganessian joue ses propres transcriptions pour orgue, dont l’Ouverture de la Flûte enchantée de Mozart, la Première Légende pour piano de Franz Liszt Saint François d’Assise. La prédication aux oiseaux.

En 2009 est paru sous le label Saphir Œuvres pour violoncelle et piano et sonates opus 5 et 28 avec Alexandre Kniazev au violoncelle. En 2010 paraît l’Intégrale des œuvres pour violoncelle et piano de Max Reger avec Alexandre Kniazev (label Saphir) et deux Quintettes de Friedrich Gernsheim (label Toccata Classics).